Rのプログラムをインストールする場合、The Comprehensive R Archive Network (CRAN)にアクセスし、左サイドバーのMirrorsを開いて、ミラーサイトを選択してからダウンロードします。日本のミラーサイトが現時点2024.07.28では山形大学の一か所だけになっています。（なお、アメリカは8か所、中国は10か所あります）。
以前は、統計数理研究所 https://www.ism.ac.jp/ もミラーサイトのひとつでしたが、それが無くなっています。
Rパッケージのインストールは、Rを起動し、パッケージメニューからCRANミラーサイトの設定を開き、ミラーサイトの一覧から、Japan (Yonezawa) [https:]を選択してOKをクリックし、同じくパッケージメニューからパッケージのインストールを選択して、パッケージの一覧から選択してOKをクリックしてインストールします。
スクリプトで同じ作業をするのであれば、以下のスクリプトを順次実行します。
chooseCRANmirror()
utils:::menuInstallPkgs()
ミラーサイトの一覧が表示されるまで少し時間がかかります。
また、chooseCRANmirror()を実行し、ミラーサイトを設定して、install.packages(“パッケージ名”)を実行することでも可能です。
さて、いくつかのパッケージをまとめてインストールしたい場合、以下のRのスクリプトを利用することもできます。この例では、metafor, forestplot, madaの3つのパッケージを続けてインストールします。packneed変数にインストールしたいパッケージ名をコンマで区切って格納します。この部分を目的に応じて書き換えてください。インストール済みのパッケージを参照して新しいパッケージだけをインストールします。url=””の部分が今までは、https://www.ism.ac.jp/ でもよかったのですが、現時点ではミラーサイトではなくなっているので、そのような設定ではパッケージのインストールができない状況です。以下のスクリプトのように、urlの設定を”https://ftp.yz.yamagata-u.ac.jp/pub/cran/”にしてください。
packneed=c(“metafor”,”forestplot”,”mada”);current=installed.packages();addpack=setdiff(packneed,rownames(current));url=”https://ftp.yz.yamagata-u.ac.jp/pub/cran/”;if(length(addpack)>0){install.packages(addpack,repos=url)};if(length(addpack)==0){print(“Already installed.”)}
このスクリプトは、Rのバージョンアップの後、今まで使っていたパッケージをすべてインストールしたい場合などに便利だと思います。